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संरचना-आधारित दवा डिज़ाइन एक रासायनिक संरचना का डिज़ाइन और अनुकूलन है जिसका लक्ष्य नैदानिक परीक्षण के लिए उपयुक्त यौगिक - एक दवा उम्मीदवार - की पहचान करना है। यह दवा की त्रि-आयामी संरचना के ज्ञान पर आधारित है और कैसे इसका आकार और आवेश इसे अपने जैविक लक्ष्य के साथ बातचीत करने के लिए प्रेरित करता है, जिससे अंततः एक चिकित्सा प्रभाव उत्पन्न होता है। दवा आमतौर पर एक कार्बनिक छोटा अणु है जो प्रोटीन जैसे जैव अणु के कार्य को सक्रिय या बाधित करता है, जिसके परिणामस्वरूप रोगी को चिकित्सीय लाभ होता है। औषधि डिज़ाइन या तर्कसंगत औषधि डिज़ाइन या केवल तर्कसंगत डिज़ाइन, जैविक लक्ष्य के ज्ञान के आधार पर नई दवाएं खोजने की आविष्कारशील प्रक्रिया है। ड्रग डिज़ाइन में छोटे अणुओं का डिज़ाइन शामिल होता है जो आकार में पूरक होते हैं और जैव आणविक लक्ष्य के लिए चार्ज होते हैं जिसके साथ वे बातचीत करते हैं और इसलिए इससे बंध जाएंगे।
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