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कोशिका आकृति विज्ञान कोशिकाओं के आकार, संरचना, रूप और आकार की पहचान करने में आवश्यक है। उदाहरण के लिए, जीवाणु विज्ञान में, कोशिका आकृति विज्ञान बैक्टीरिया के आकार, कोक्सी, बेसिली, सर्पिल आदि और बैक्टीरिया के आकार से संबंधित है। इस प्रकार, जीवाणु वर्गीकरण में कोशिका आकृति विज्ञान का निर्धारण आवश्यक है।